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emsa是用特定序列的标记探针,同待验证蛋白孵育后进行native-page凝胶电泳,如果存在同探针结合的蛋白,则会出现电泳迁移率明显低于自由探针的条带出现。 dna pull-down是将探针结合在凝胶/磁珠上,以此收集同该dna探针发生互作的蛋白。chip实验中所检测的dna-蛋白互作则发生在活组织细胞内。
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