由于核酸在260 nm附近有强吸收，而蛋白质在280 nm附近有强吸收，从生物体内提取核酸时，常用od260/od280比值来评价核酸纯度 (比值在1.8～2.0之间)，这一判断是基于序列中a、g、c、t所占比例大致相同时的结果。而合成的dna/rna则不同，序列很短 (通常在20～30个碱基之间)，其中a、g、c、t各种碱基所占比例很不相同，由于各种碱基的摩尔消光系数不同，因此不同碱基构成的合成dna/rna制品的od260/od280比值也不同，例如当序列中c、t碱基的含量高时，该比值会大大低于1.8。此外，序列中碱基的排列顺序也影响该比值。所以不能根据od260/od280比值来评价合成dna/rna制品的纯度。
oligo dna的电泳一定要使用变性page电泳。oligo dna是单链dna，容易形成复杂的立体结构，因此进行agarose电泳时，容易出现多条泳带 (更无法用agarose电泳进行定量了)。
a、g、c、t的组份不同，电泳速度不同； dna的立体结构不同，电泳速度不同。 这种情况在oligo dna越短时越容易发生，长链oligo dna之间差别越小。
没有，5' 和3' 末端均为-oh基。如需要加磷酸基团，订货时请特别注明，此时需收取磷酸化 (po4修饰) 的费用。
不能。 因为etbr是通过嵌入到核酸的双螺旋间而使其着色的。合成的dna/rna分子为单链，只有通过自身回折形成局部发夹环结构或链间形成部分双螺旋结构，才能被etbr染色。由于不同制品的序列不同，形成双螺旋的能力不同，因此染色能力不尽相同，也就不能根据etbr染色带的亮度来对合成的dna/rna进行定量。
连接反应的引物如果没有5’磷酸基团，连接效率相对较低，但不是完全不能成功。 如果磷酸化的产物还不能连接载体上，需要检查载体的酶切效果以及核对引物的设计方案，如果都没有问题就要考虑改善引物退火的条件以及连接反应体系。
合成dna的长度为6～130个碱基；合成rna的长度为8～35个碱基。当合成的dna序列较长时，由于合成及纯化方法的限制,很难保证制品中每个序列都正确无误。此外需要说明的是：如果待合成序列比较特殊 (例如多个“g”连续出现等)，合成收率相对较低，我们可能会根据具体情况加收费用；有时我们也可能无法合成订购的序列，此时本公司保留不接受定单的权利。
干燥制品很稳定，-20℃下保存2年没问题。 溶解后的dna也请保存于-20℃，最好是分份保存，避免反复冻融。 溶液中的oligo dna在常温下放置3～4天应该没问题，但最好不要放置一个星期以上。其寿命与容器、溶剂的灭菌程度有关。
如果您溶解引物的水ph过低或污染了菌或核酸酶，会使引物降解。使用时没有充分解冻混合，液体不均匀也可能会造成引物加入量不准确。建议分装引物，避免反复冻溶。建议使用10mm tris ph7.5缓冲液溶解引物，因为有些蒸馏水的ph值比较低（ph4-5）, 引物在这种条件下不稳定。还有一种可能性是引物没有问题，而是pcr使用材料特别是模板的质量与先前使用的不完全一致。
合成的引物和您的定单序列一致，而不是能否扩增出您所需要的产物。
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