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免疫印迹实验步骤及问题解决
文章来源:genecreate 作者:genecreate 发布时间:2019-01-21 16:43
一、实验步骤
试剂和缓冲液
1x ripa 缓冲液: 50 mm tris, 150 mm nacl, 0.1% sds, 0.5% sds, 1% triton x-100 或np40.
1x pbs 缓冲液: 137 mm nacl, 2.7 mm kcl, 2.7 mm na2hpo4, 2.7 mm kh2po4, ph 7.4
bca或bradford蛋白分析试剂盒
1.5 m tris缓冲液 (ph 8.8): 90.68 g tris-hcl to ddh2o, 500 ml溶液ph调节到8.8
1.0 m tris缓冲液 (ph 6.8): 60.58 g tris-hcl to ddh2o, 500 ml溶液ph调节到6.8
10% aps: 100 mg ap 溶于1 ml ddh2o。 用前准备
10% sds: 10 g sds溶于100 ml ddh2o。
1x tris-甘氨酸电泳缓冲液: 25 mm tris, 230 mm 甘氨酸 (ph 8.3), 0.1% sds。
3x sds蛋白加样缓冲液: 150 mm tris (ph 6.8), 6% sds, 30% 甘油, 30 mm edta和0.2% 溴酚蓝
1x ttbs: 25 mm tris(ph 7.5): 0.15 m nacl, 0.05% tween-20, 0.001% 硫柳汞
1x 转移缓冲液: 3 g tris, 14.4 g甘氨酸和200 ml甲醇,加ddh2o 到1l
样品准备
细胞培养样品
 
贴壁细胞
去除培养基,用1x pbs冲洗去掉残留培养基
加入预冷的400 ul-1 ml 1x ripa缓冲液/100 mm平皿。 在冰上孵育5-10 min。
完全刮下细胞并转移到在冰上预冷的1.5 ml离心管中。
(可选)充分混匀或超声处理。
4°c下12,000 rpm离心10-15 min并收集上清
总蛋白用前需储存在-20°c。
 
悬浮细胞
(可选)取出100 ul细胞培养也进行细胞计数。
将细胞转移到预冷的1.5 ml或15 ml离心管2000 rpm 4°c离心5 min。
去除培养基并用1 ml预冷的1x pbs重悬细胞,然后转移到1.5 ml离心管中。
2000 rpm 4°c离心5 min。
用1 ml预冷的ripa 缓冲液/107细胞重悬细胞
细胞悬液在冰上孵育并摇床30 min,或充分混匀或超声处理。
4°c 12000 rpm离心10-15 min收集上清备用。
总蛋白需要在用前储存在-20°c 。
 
组织
组织准备和定量。将组织切成小块。
加入500-600 ul预冷的1x ripa缓冲液/100 mg 组织。
将组织充分混匀
4°c 12000 rpm离心15-20min。
收集上清。
总蛋白在用前应储存在-20°c。
 
蛋白定量
bradford分析和bca分析请查看来邦的综述 蛋白定量。
 
sds-page
聚丙烯酰胺凝胶
6%-15% 分离胶上注入5%的浓缩胶并插上梳子(10或者15孔)。
分离胶浓度(%) 蛋白大小范围(kda)
8 25-200
10 15-100
12.5 10-70
15 12-45
20 4-40
表1: 蛋白分离范围由分离胶浓度决定。
 
上样和电泳
2x sds蛋白上样缓冲液与蛋白样品1:1充分混匀。
注胶前先将样品在50-60°c预热。预染marker可用于监控蛋白分离和转移效率。
在1x tris-甘氨酸缓冲液在60-120v跑电泳1-3小时
分离胶(10ml) 浓缩胶(3ml)
  6% 8% 10% 12% 15% 6%
h20 5.3 4.6 4.0 3.3 2.3 2.1
30% 丙烯酰胺混合物* 2.0 2.7 3.3 4.0 5.0 0.5
1.5m tris(ph 8.8) 2.5 2.5 2.5 2.5 2.5 1.0m tris (ph 6.8) 0.38
10% sds 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.03
10% aps 0.1 0.1 0.1 .1 0.1 0.03
temed 0.008 0.006 0.004 0.004 0.004 0.003
表2:分离胶(10ml)和浓缩胶(3ml)的制备方案
 
蛋白转移
将蛋白转移到pvdf或nc*膜上进行抗体检测
1.将电泳材料,如胶、whatman纸和海绵放入1x转移缓冲液中预先浸润.
2.pvdf膜应在甲醇中预先孵育10秒到1分钟,然后移入转移缓冲液中
3.将材料按如下顺序放置:板(黑色面), 海绵, whatman纸, 胶, 膜, whatman纸, 海绵, 板(亮面).
4.将转移装置安置好,黑色面对应黑色电极。
5.转移到冷的1x转移缓冲液中.电转电流和时间应该根据电泳装置的厂家说明推荐设置。
* nc膜不能用甲醇孵育。
 
将膜放入溶有5%脱脂奶粉的1x tbst中25°c孵育1小时 (或在摇床上4°c孵育过夜)。
抗体孵育
1.按照推荐浓度或根据结果优化浓度,将一抗溶于1x tbst+3% bsa中。
2.在4°c孵育过夜或更长时间,或者在室温下4小时。
3.回收一抗,保存在4°c。然后在室温下在摇床上冲洗膜三次,每次5-10 min。
4.将二抗放入1x tbst中稀释,然后室温下孵育膜1小时,或4°c摇床上2-4小时。
5.在室温摇床上用tbst洗三次,每次10 min
ecl+ 系统和x-ray胶卷被用于hrp标记的二抗。
 
二、问题解决
没有信号,可能原因
检测的二抗用错了(明确一抗制备的宿主)
一抗或二抗的浓度太低(提高浓度再试一次)
一抗不能识别检测物种的蛋白(检查一抗的特异性)
上样蛋白量太少(增加样品的量)
转移效率太低(改进转移实验步骤。确保pvdf膜用之前用甲醇预孵育)
一抗已经被用很多次了(使用重新稀释的一抗)
封闭时间太长或者洗涤次数太多(减少封闭时间和洗涤次数)
检测试剂盒失效(加入阳性对照并确保试剂盒有效)
叠氮化钠可能抑制二抗(溶解缓冲液中应避免使用叠氮化钠)
一抗或二抗的孵育时间太短(延长孵育时间)
 
背景太亮
封闭时间太短或者封闭缓冲液有问题(延长封闭时间或者用bsa代替脱脂奶粉)。
一抗或二抗浓度太高。(降低抗体浓度)
洗脱不充分(增加洗脱次数)
孵育温度太高 (确保一抗在4°c孵育)
膜使用错误或者膜已经干了 (避免膜变干)
 
白色条带或者信号消失很快
一抗或二抗浓度太高(降低抗体浓度)
 
条带弯曲
电泳电压太高,或者电泳过程中缓冲液温度太高。(降低电压,电泳缓冲液置于冷的环境中)
 
条带弥散
一抗或二抗浓度太高(降低抗体浓度)
上样蛋白量太大 (降低上样量)
 
空白区域
转移不均衡(确保膜均衡的贴到胶上,没有气泡)
非特异性信号
一抗或二抗浓度太高(降低抗体浓度)
 
条带脏或者模糊
平衡时间不够,或者胶与膜的接触不均衡。(确保胶没问题,改进转移步骤)
 
秃斑
胶与膜之间有气泡(确保胶与膜之间没有气泡)
 
条带大小与理论不符
一抗特异性差(更换一抗)
一些蛋白可能移动与理论大小差别较大。
 
不能阐释可能的翻译后修饰
翻译后修饰例如多聚(adp-核糖基)-par链(它能够介导蛋白分子带负电荷)不能通过sds-page分别。 不过它们能通过ctab-page分开。 ctab, 溴化十六烷基三甲基铵 ((c16h33)n(ch3)3br, cetyltrimethylammonium bromide, hexadecyltrimethylammonium bromide)是一种基于氨阳离子的表面活性剂。
 

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