技术专题
国科金专题辅导讲座回顾 || 肿瘤蛋白质组学专题（内含课件）
文章来源：genecreate
作者：genecreate
发布时间：2020-06-01 16:33
时至三月，国自然考试已悄然进入“最后冲刺阶段”，国科金申请书到底怎么修改才好？纵观历年国自然申请情况，客观准确地挖掘关键机制、筛选关键因子，对于基金中标至关重要。
蛋白质组学技术因其高通量、客观、稳定等特性成为面上乃至重大项目的中标利器之一。将蛋白质组学的技术方法应用到肿瘤生物学的研究中,产生了一门新学科——肿瘤蛋白质组学。肿瘤蛋白质组学经历了表达谱、修饰谱到活性谱的进化过程,在不同的层面上揭示肿瘤可能的致病机制。研究统计发现肿瘤相关审报项目数目和肿瘤蛋白质组学相关文献也呈逐年快速增长趋势。
- 什么是蛋白质组学技术？
- 肿瘤/癌症蛋白质组学有哪些重要资源？
- 蛋白质组学技术有哪些应用？
- 肿瘤蛋白质组学相关课题研究思路有哪些？
在上期题为《国科金专题辅导讲座--蛋白质组学专题的》讲座中，赵老师就以上内容做出了详细解答，线上听课人数高达800 ，反响非常热烈。在此我们要再次感谢各位专家老师的认可与信赖！我们将一如既往地提供优质讲座服务给大家，希望对您的科研事业有所助益！
以下是上期讲座精彩回顾，请您雅鉴~ ~
肿瘤蛋白质组学相关课题总结
研究耐药机制
• 补体膜调控蛋白参与肿瘤抗体治疗耐药的分子机制
• pdgfd的表观遗传学调控及其在肿瘤耐药中的作用
• 成纤维细胞激活蛋白响应的肿瘤及肿瘤微环境双靶向给药系统的研究
发现肿瘤相关的特定信号通路
• sr蛋白通过wnt信号调控肿瘤细胞增殖的机制研究
• lmo2调控前列腺癌恶化和转移相关的信号通路与蛋白质组学研究
• tlrs信号通道对hh-lps致肝细胞线粒体蛋白质组影响的分子机理
肿瘤发生的机制研究
• 肿瘤相关蛋白调控细胞凋亡过程的分子模拟研究
• 蛋白修饰导致sh3bgrl在肿瘤中表达上调及在肿瘤发生、转移中的机理
• pten家族蛋白在肿瘤代谢异常中的调控机制研究
肿瘤免疫应答及机制研究
• 抗体识别肿瘤muc1糖肽的分子免疫学机制研究
• 肿瘤源性骨桥蛋白诱导髓系抑制性细胞促进肿瘤免疫逃逸机制研究
• sting蛋白调节树突状细胞介导的肿瘤免疫研究
• 结核分枝杆菌热休克蛋白65-肿瘤细胞裂解物抗肺癌疫苗的改进研究
肿瘤诊断
• 基于mrm技术的血清免疫球蛋白肿瘤特异性糖多肽的鉴定及其联合cea精准诊断结直肠癌的应用
• 蛋白质组学技术用于急性白血病诊断及分型的研究
• 基于转录组学和血清蛋白质组学包虫病诊断标志物的筛选及其免疫应答机制的研究
• 免疫蛋白质组学筛查、鉴定具有早期诊断价值的人胰腺癌相关膜抗原
肿瘤蛋白质组学的重要资源
蛋白质组学相关课题一般设计思路
蛋白质组学相关文章的最低要求：前三步骤，后三步属于加分项（10分以下）
大样本量蛋白质组学也成为当前科研趋势，即大量样品蛋白质组学测量，然后数据深度挖掘，少量验证（cns或其子刊级别）
相关性研究：少量样本发现 大量样本验证
机制研究：先通过组学手段发现差异表达基因（或/和翻译后修饰状态的变化），再通过一系列下游的分子实验阐明其作用 机制，往往同时结合第4-6步
肿瘤标志物研究案例
生理病理机制研究案例
1. proteasome machinery is instrumental in a common gain-of-function program of the p53 missense mutants in cancer. nature cell biology. if:19
2. quantitative proteomics using silac‐ms identifies n‐acetylcysteine‐solution‐triggered reversal response of renal cell carcinoma cell lines. journal of cellular biochemistry. if: 3.1
3. p53 pathway dysfunction is highly prevalent in acute myeloid leukemia independent of tp53 mutational status. leukemia. if:12.1
4. identification and characterization of potential biomarkers by quantitative tissue proteomics of primary lung adenocarcinoma[j]. molecular & cellular proteomics mcp, if:5.7
5. photocatalyzing co2 to co for enhanced cancer therapy[j]. advanced materials. if:21.95
药物靶标筛选案例
1. pdgf receptors as cancer drug targets. cancer cell.if: 22.8
2. mir-122 targets x-linked inhibitor of apoptosis protein to sensitize oxaliplatin-resistant colorectal cancer cells to oxaliplatin-mediated cytotoxicity. cell physiol biochem. if:5.5
3. g protein-coupled receptors: novel targets for drug discovery in cancer. nat rev drug discov. if: 50.16
总结
肿瘤的主要研究热点
✓ 更好的诊断方法
✓ 更好的治疗方法（个性化诊疗）
蛋白质组学技术介绍
✓ itraq定量技术，一种同位素标记的定量方法，使用广泛
✓ swath/dia定量技术，一种新的全扫描的定量技术，有望取代其他定量技术
✓ prm/mrm 靶向定量技术， 对基于“发现”水平的差异表达蛋白的验证
蛋白质组学在肿瘤临床研究中的应用
✓ 肿瘤标志物发现的蛋白质组学策略
✓ 肿瘤发生发展的分子机制研究策略
✓ 个性化诊疗的基本思路
武汉金开瑞蛋白质组学平台
平台引进了先进的sciex tripletof 5600 液质联用系统、 q exactive™ hf 组合型四极杆-orbitrap ms，可提供蛋白质鉴定、定量蛋白质组、修饰蛋白质组、互作蛋白质组等全方位的蛋白质组学相关服务。
稳定的实验方案，严格的质控标准，专业的技术团队，提供个性化数据分析和终身免费售后，可保证您的实验达到最优效果。
自平台成立至今，已服务了500 家高校、科研院所、医院，遍布全国各地；完成了万例个生物样本，分析的物种达180多种，囊括了从模式生物到普遍高等动植物到细菌、真菌和病毒等几乎所有类型物种；涉及的样本类型从动物各类组织器官、各种细胞系、植物各类组织以及多种动物体液（血液、尿液、脑脊液、唾液、毒液等）到微生物菌体及病毒。
部分客户已发表文献
photo-powered artificial organelles for atp generation and life-sustainment. advanced materials (if=21.95), 2018. (合作技术：label-free)
photocatalyzing co2 to co for enhanced cancer therapy. advanced materials (if=21.95), 2017. (合作技术：itraq)
exome-wide analysis identifies three low-frequency missense variants associated with pancreatic cancer risk in chinese populations. nature communications (if=12.353), 2018. (合作技术：磷酸化itraq)
optically-controlled bacterial metabolite for cancer therapy. nature communications (if=12.353), 2018. (合作技术：itraq)
combined spectroelectrochemical and proteomic characterizations of bidirectional alcaligenes faecalis-electrode electron transfer. biosensors & bioelectronics (if=8.173), 2018. (合作技术：swath)
chemical signals stimulate geobacter soli biofilm formation and electroactivity. biosensors & bioelectronics (if=8.173), 2019. (合作技术：swath)
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