cdna文库构建及互作蛋白筛选方法-凯发k8网页登录
cdna文库构建是一种重要的分子生物学技术,可以用于快速克隆与表达特定基因的cdna。本文将介绍cdna文库构建的基本步骤及互作蛋白筛选方法。
一、cdna文库构建
rna提取——从目标组织或细胞中提取总rna,采用三氯化锂等离子体法或trizol法处理后测定rna质量,并在rnase-free条件下进行操作。
cdna合成——使用逆转录酶把rna转录为cdna。反转录反应中添加随机引物,以确保对全长cdna的覆盖。
后续处理——合成cdna后,需要消除rna残余和rna-cdna杂交分子,如诱导双链rna(dsrna)的副产物等。此步骤还可用于修剪多余部分,如启动子区域,3'端非编码序列和其他转录调控元件。
cdna片段连接——使用连接酶将修剪后的cdna片段连接到载体上。这些载体通常是质粒或噬菌体,携带有切除酶酶切位点。连接后的文库应该被电转化或感染到相关的细胞中,以便加以培养和筛选表达目的基因。
二、互作蛋白筛选方法
酵母双杂交法——酵母双杂交法是目前最广泛使用的互作蛋白筛选技术之一。酵母细胞中的转录激活子结合到特定dna序列上,从而实现报告基因表达的调控。这种方法可以用于鉴定蛋白质与蛋白质之间的相互作用,但不能鉴定酶与底物的相互作用。
噬菌体展示技术——噬菌体展示技术利用噬菌体颗粒表面的融合蛋白展示靶标蛋白,鉴定融合蛋白与靶标蛋白之间的相互作用。该方法通过遗传学选择或筛选技术可快速高效地获得互作蛋白。
质谱分析法——质谱分析法是一种用于特定蛋白质的互作鉴定的技术。它涉及把纯化的互作复合物进行质量谱分析,比较不同样品的质谱图,确定哪种蛋白质相互作用。缺点是需要充足的纯化和样品预处理。
三、总结
cdna文库构建是高效快捷地获取目标基因cdna序列和表达的方法。互作蛋白筛选方法主要有酵母双杂交法、噬菌体展示技术和质谱分析法。这些技术在研究与治疗人类疾病等方面具有广泛应用前景。
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